AI Tools Bootcamp for Medical Researchers

Super-charge your research in just two days!

Busy with clinics, teaching … and still expected to publish?
Join our fast-paced, hands-on bootcamp and leave with an AI-powered workflow that saves hours every week.

Why attend?

  • Do more in less time – automate literature searches, data analysis and writing tasks.
  • Stay compliant – learn the latest research-integrity & data-privacy rules.
  • Cut through the hype – test the leading generative-AI and retrieval-augmented tools side by side.
  • Immediate take-aways – every session ends with a guided practice and ready-to-use prompts or templates.

Concepts to be discussed

Module

Focus

Key Take-aways

Generative AI Fundamentals
(2–3 h)

Frontier vs RAG, prompt design

Build a custom ChatGPT in 15 min

Research Integrity & Privacy
(1.5–2 h)

Responsible AI use

Set safe GPT privacy defaults

Research Question & Study Design
(1–2 h)

Brainstorming, study architecture

10-step AI check-list for protocol design

Literature Review
(3–4 h)

Deep search & summarisation

Turn a PDF folder into an evidence map

Data Analysis
(3–4 h)

Quant & Qual analytics

Run stats & graphs with one prompt

Research Writing 
(5–6 h)

Articles, grants, custom GPTs

Draft a manuscript section in class

Funding & Publication Strategy (select sessions)

Grant mining, journal fit

AI tools that spot calls & journals for you

Dissemination & Multimedia 
(3–4 h)

Images, posters, social media

Generate conference-ready visuals

Meet your instructor: Dr. Avi Staiman

Thought-leader on responsible AI in research, creator of “AI Tool-Up Tuesdays” (5 000+ researchers trained) cassyni.com; earma.org.
Core member of CANGARU, representing the European Association of Science Editors in drafting global AI-use guidelines (scholarlykitchen.sspnet.org; digital-science.com).
Guest lecturer at NYU & the University of Tokyo; essays in Cambridge University Press Blog, Digital Science and Times Higher Education (digital-science.com).

Format

  • Live online lectures/demonstrations followed by guided practice.
  • Small-group (maximum 25 participants) “clinics” where you learn how to use/apply AI tools to your own project.
  • Taught in English.

Date & venue

  • When (reserve your seat now!):
    • 14-15 October 2025.
    • 18-19 November 2025.
    • 25-26 November 2025.
  • Where: online stream organized by Dr. Staiman

Who should attend?
UMFVBT staff (permanent and temporary positions) and master/doctoral/VADA students who juggle clinical duties with teaching and research.

Registration (free for UMFVBT employees)
Email ai-bootcamp@umft.ro with the subject AI-Bootcamp, containing your name, department and chosen date.
Seats are limited (25/session!) – confirmation is first-come, first-served.

 

1. INFORMAȚII GENERALE
  • Director proiect: Prof. univ. dr. Cristian Oancea 

Cod final de înregistrare:

CNFIS-FDI-2025-F-0322

Denumire instituţie:

UNIVERSITATEA DE MEDICINA SI FARMACIE ” VICTOR BABEŞ ” TIMISOARA

Titlu proiect:

Bio-AI Synergy: Cluster de Inteligența Artificiala și Tehnici Moleculare Avansate pentru Dezvoltarea Cercetării Biomedicale în UMFVBT

Domeniu vizat:

6.Dezvoltarea capacității instituționale pentru cercetare din instituțiile de învățământ superior

Bugetul aprobat:

340.000 LEI

2. OBIECTIVE, ACTIVITĂŢI ŞI REZULTATE ASUMATE

 

Nr. Crt.

Denumire scurtă Obiectiv specific

Obiectiv Nomenclator Național – corelare

Detaliere Obiectiv specific

1

OS.1: Integrarea instrumentelor IA în procesul de cercetare biomedicală

OG6.6.Susținerea activităților desfășurate de instituțiile de învățământ superior pentru dezvoltarea cercetării universitare

OS.1 Integrarea instrumentelor IA în procesul de cercetare biomedicală, pornind de la fundamentele teoretice și normele de protecție a datelor, până la aspectele practice de analiză, redactare și publicare a rezultatelor științifice.
Pentru îndeplinirea acestui obiectiv, UMFVBT plănuiește organizarea a cel puțin trei sesiuni de training online (pentru minim 60 de participanți), structurate în șapte module concepute pentru a acoperi întregul flux al cercetării, de la inițierea în IA și respectarea integrității academice, până la analiza datelor, redactarea lucrărilor și obținerea finanțărilor:

  1. Modulul A: Instrumente de inteligență artificială generativă pentru cercetători (3-4 ore)
  2. Modulul B: Integritatea cercetării Çi confidențialitatea datelor (1-1,5 ore)
  3. Modulul C: Literature review Çi generarea de întrebări de cercetare relevante (5-6 ore)
  4. Modulul D: Analiza de date (3-4 ore)
  5. Modulul E: Research Writing (5-6 ore)
  6. Modulul F: Editarea textelor și detectarea folosirii IA (3-4 ore)
  7. Modulul G: Propuneri de granturi și strategii de publicare (5-6 ore)

Fiecare modul include sesiuni practice, menite să asigure dobândirea de competențe aplicabile în proiectele de cercetare curente ale participanților.

 2

 OS.2: Înființarea și operaționalizarea unui cluster de IA bazat pe mai multe dispozitive Apple Macintosh

 OG6.1.Suport pentru activitățile de excelență în cercetare

OS.2 Înființarea și operaționalizarea unui cluster de IA bazat pe mai multe dispozitive Apple Macintosh (dintre care minim unul, MacStudio va fi achiziționat in cadrul acestui proiect).
Ne propunem crearea și funcționalizarea unui cluster de inteligență artificială compus din unități cu memorie GPU rapidă, capabile să ruleze modele IA bazate pe arhitectura MoE (Mixture of Experts). În acest sens, soluțiile Apple se dovedesc mult mai rentabile comparativ cu alternativele NVIDIA Çi AMD, oferind:
• O cantitate mare de memorie unificată, la un preț per GB sub 30 USD;
• Lățime de bandă suficientă pentru antrenarea și rularea unor modele de mari dimensiuni;
• Tehnologia UltraFusion, care unește cipuri (ex. M2, M3, M4) într-un singur modul ultra-performant, printr-o conexiune de 2,5 TB/s.

Un astfel de sistem ar putea rula, de exemplu, versiunea 4-bit a modelului DeepSeek (671B parametri) la aproximativ 57 tokeni pe secundă, oferind posibilitatea de a procesa modele IA de anvergură local, fără a apela la servicii cloud foarte costisitoare.
Menționăm că întregul suport bioinformatic dezvoltat pe proiectele de metagenomică anterioare este centrat pe tehnologia Apple.

3

 OS.3: Extinderea repertoriului de tehnici moleculare bazate pe secvențierea Nanopore

OG6.6.Susținerea activităților desfășurate de instituțiile de învățământ superior pentru dezvoltarea cercetării universitare

OS.3 Extinderea repertoriului de tehnici moleculare bazate pe secvențierea Nanopore
Proiectul CNFIS-FDI-2024-F-0451 Pluriseq@UMFVBT s-a dovedit a fi un real succes, depăÇind estimările inițiale Çi susținând în prezent cinci proiecte de cercetare care utilizează tehnicile de metagenomică implementate prin intermediul acestuia. Din discuțiile cu cercetătorii UMFVBT a reieÇit necesitatea inițierii unui proiect pilot în domeniul bacteriofagilor, la solicitarea explicită a specialiștilor din microbiologie, virusologie Çi boli infecțioase. Acest demers va extinde și completa proiectul de metagenomică dezvoltat prin proiectul anterior CNFIS-FDI-2024-F-0451 Pluriseq@UMFVBT, permițând:
• Introducerea unor tehnologii de vârf în microbiologie;
• Formarea de competențe specializate pentru cercetători;
• Stimularea cooperării interdisciplinare atât în cadrul universității, cât și cu instituții externe;
•  Identificarea unor noi oportunități de transfer tehnologic și aplicații biomedicale.

4

OS.4: Management și implementare proiect

OG6.5.Alte obiective specifice domeniului, pe care universitatea le propune la nivel institutional

Coorodonarea echipei de proiect în vederea îndeplinirii obiectivelor asumate și a activităților propuse, conform calendarului proiectului. Întocmirea documentelor pentru raportările tehnico-financiare intermediară și finală.

 

Nr. Crt.

Denumire scurtă Activitate

Obiectiv Specific la care contribuie

Detaliere Activitate

 1

A.1 Identificarea furnizorilor de training online

OS.1: Integrarea instrumentelor IA în procesul de cercetare biomedicală

Se vor selecta partenerii de instruire capabili să furnizeze toate modulele menționate, asigurând coerența și calitatea conținutului. Efectuarea achiziției pentru aceste servicii de training.

 2

A.2 Lansarea anunțului public  privind desfășurarea sesiunilor de training

OS.1: Integrarea instrumentelor IA în procesul de cercetare biomedicală

Prin canalele oficiale ale UMFVBT (website, newsletter, rețele de socializare), se va comunica programul și condițiile de participare la sesiunile de training.

 3

A.3 Înregistrarea participanților la sesiunile de training

OS.1: Integrarea instrumentelor IA în procesul de cercetare biomedicală

Se va gestiona procesul de înscriere (formular online, confirmări), urmărindu-se formarea de grupe echilibrate din punct de vedere al nivelului de experiență și al domeniilor de interes.

 4

 A.4 Organizarea și monitorizarea sesiunilor de training

 OS.1: Integrarea instrumentelor IA în procesul de cercetare biomedicală

În fiecare sesiune online se vor desfăÇura toate cele șapte module, respectând conținuturile programate. Vor fi colectate rapoarte de participare pentru a evalua succesul fiecărei sesiuni.
Prin această abordare modulară, UMFVBT își propune să asigure o pregătire completă a cercetătorilor în ceea ce privește utilizarea inteligentă și etică a instrumentelor de IA, îmbunătățind calitatea și eficiența activității științifice de la nivel instituțional

5

 A.5 Designul clusterului IA

OS.2: Înființarea Çi operaționalizarea unui cluster de IA bazat pe mai multe dispozitive Apple Macintosh

Definirea arhitecturii și a modului de interconectare între unitățile Apple pentru a asigura o eficiență optimă.

 6

  A.6 Achiziția a cel puțin unui Apple Mac Studio

 OS.2: Înființarea și operaționalizarea unui cluster de IA bazat pe mai multe dispozitive Apple Macintosh

Achiziția unei unități Apple MacStudio ce va asigura puterea de calcul necesară și va completa rețeaua de Mac-uri existente. Configurație optimă: 32-core CPU, 80-core GPU, 32-core Neural Engine, 512 GB memorie unificată, 1 TB SSD.

 

7

 A.7 Instalarea de software de conectare și optimizarea comunicării între dispozitivele Apple

  OS.2: Înființarea și operaționalizarea unui cluster de IA bazat pe mai multe dispozitive Apple Macintosh

Instalarea de software de conectare și optimizare a comunicării între dispozitivele Apple – contribuie la îndeplinirea obiectivului OS.2 prin utilizarea soluțiilor ExoLabs (sau echivalente) pentru integrarea nodurilor în cluster Çi gestionarea sarcinilor distribuite.

 8

 A.8 Rularea și antrenarea locală a modelelor IA

 OS.2: Înființarea și operaționalizarea unui cluster de IA bazat pe mai multe dispozitive Apple Macintosh

Testarea practicilor de antrenare și inferență pe modele de mari dimensiuni, folosind resursele clusterului în regim local.
Prin aceste etape, universitatea își va consolida capacitatea de calcul distribuit și va facilita dezvoltarea proiectelor de cercetare ce necesită volume semnificative de resurse pentru inteligență artificială.

 9

 A.9 Analiză bibliografică

OS.3: Extinderea repertoriului de tehnici moleculare bazate pe secvențierea Nanopore

Analiza bibliografică și identificarea celor mai bune protocoale pentru izolarea, purificarea, caracterizarea biologică și analiza moleculară a bacteriofagilor.

10

 A.10 Achiziția consumabilelor Çi reactivilor și kit-urilor de reactivi

 OS.3: Extinderea repertoriului de tehnici moleculare bazate pe secvențierea Nanopore

Achiziția consumabilelor de laborator și a reactivilor necesari culturilor bacteriene, precum și pentru purificarea și concentrarea bacteriofagilor.
Achiziția consumabilelor, reactivilor Çi kit-urilor destinate caracterizării biologice (activitatea litică, determinarea spectrului de gazdă) și moleculare (prin secvențiere Nanopore) a bacteriofagilor.

 11

A.11 Elaborarea și diseminarea ghidului

OS.3: Extinderea repertoriului de tehnici moleculare bazate pe secvențierea Nanopore

Elaborarea și diseminarea unui ghid privind izolarea și caracterizarea biologică și moleculară a bacteriofagilor

 12

A.12 Analiză bioinformatică a rezultatelor

OS.3: Extinderea repertoriului de tehnici moleculare bazate pe secvențierea Nanopore

Analiză bioinformatică a rezultatelor, incluzând asamblarea de novo a genomului, anotarea funcțională și analiza filogenetică

 13

A.13 Ședințe de consiliere

OS.3: Extinderea repertoriului de tehnici moleculare bazate pe secvențierea Nanopore

Ședințe de consiliere în vederea inițierii și susținerea desfășurării proiectelor de cercetare ce includ analiza bacteriofagilor

 14

 A.14 Management și implementare L1-L9

 OS.4: Management Çi implementare proiect

Managementul și implementarea proiectului presupun coordonarea echipei proiectului în scopul îndeplinirii obiectivelor asumate, conform calendarul stabilit; realizarea achizițiilor necesare derulării proiectului; organizarea și realizarea sesiunilor training online privind integrarea instrumentelor IA în procesul de cercetare biomedicală; organizarea și realizarea sesiunilor de consiliere în vederea inițierii și susținerea desfăÇurării proiectelor de cercetare ce includ analiza bacteriofagilor; publicarea informațiilor despre proiect pe pagina dedicată din cadrul site-ului UMFVBT; întocmirea documentelor aferente raportărilor tehnice Çi financiare intermediară și finală.
L1-L9

Nr. Crt.

Rezultat specific

Rezultat Nomenclator Național – corelare                                   

Detaliere rezultat specific

Activitate aferentă

 1

R1. Contract de furnizare training online

 RG6.01. Aplicații și instrumente IT

1 contract rezultat din selectarea furnizorului de training online în utilizarea instrumentelor IA în cercetare

A.1 Identificarea furnizorilor de training online

  2

R2. Anunț public privind desfășurarea sesiunilor de training online

 RG6.10. Alte rezultate specifice domeniului, pe care universitatea le propune la nivel instituțional

1 anunț public privind desfăÇurarea sesiunilor de training, care cuprinde un material oficial de promovare, calendarul cursurilor, modalitatea de înscriere și criteriile de selecție a participanților

A.2 Lansarea anunțului public privind desfășurarea sesiunilor de training

 3

R3. Instrument online de înscriere la sesiunile de training

 RG6.01. Aplicații și instrumente IT

1 instrument online pentru înregistrarea participanților la sesiunile de training privind utilizarea instrumentelor IA în cercetare

A.3 Înregistrarea participanților la sesiunile de training

 4

R4. Lista participanților la sesiunile de training online

RG6.05. Cadre didactice/ personal didactic auxiliar perfecționate/specializate/evaluate

1 listă de cercetători participanți la curs (minim 60) împreună cu statistici de prezență și feedback post-eveniment

A.4 Organizarea și monitorizarea sesiunilor de training

 

5

R5. FiÇa design structural Çi funcțional

 RG6.01. Aplicații și instrumente IT

1 fișă design structural și funcțional a clusterului IA bazat pe instrumente Apple Mac

A.5 Designul clusterului IA

6

 R6. Dosar achiziție instrument MacStudio

 RG6.01. Aplicații și instrumente IT

1 dosar de achiziție a unui instrument MacStudio (32-core CPU, 80 core GPU, 32-core Neural Engine, 512 GB unified memory, 1TB SSD memory)

A.6 Achiziția a cel puțin unui Apple Mac Studio

 7

 R7. Jurnal(e) de instalare și screenshot al fiÇierelor de configurare

 RG6.10. Alte rezultate specifice domeniului, pe care universitatea le propune la nivel instituțional

Minim 1 jurnal de instalare și screenshot al fișierelor de configurare

A.7 Instalarea de software de conectare și optimizarea comunicării între dispozitivele Apple

8

R8. Jurnal de rulare de aplicații și de execuție de aplicații (sau screenshot rulare și execuție aplicații)

RG6.10. Alte rezultate specifice domeniului, pe care universitatea le propune la nivel instituțional

 1 jurnal de rulare de aplicații Çi de execuție de aplicații (sau screenshot rulare Çi execuție aplicații)

A.8 Rularea și antrenarea locală a modelelor IA

9

R9. Raport de analiză bibliografică

 RG6.10. Alte rezultate specifice domeniului, pe care universitatea le propune la nivel instituțional

1 raport de analiză bibliografică ce prezintă cele mai recente metode Çi bune practici în izolarea, purificarea, caracterizarea biologică și analiza moleculară a bacteriofagilor

 A.9 Analiză bibliografică

 10

 R10. Lista de achiziții

 RG6.10. Alte rezultate specifice domeniului, pe care universitatea le propune la nivel instituțional

1 listă de achiziții materiale/reactivi/consumabile pentru cultivare/purificare și caracterizare biologică/moleculară a bacteriofagilor

A.10 Achiziția consumabilelor și reactivilor și kit-urilor de reactivi

  11

 R11. Ghid metodologic complet (format digital)

 RG6.02. Materiale/ instrumente pentru susținerea cercetării (proceduri/lucrări științifice/suporturi de curs/curricule)

1 ghid metodologic complet (format digital) publicat online pe pagina proiectului din cadrul site-ului UMFVBT, care include: descrierea etapelor de izolare, purificare, identificarea spectrului de gazdă, activități litice, pregătirea bibliotecilor pentru secvențiere, pipeline bioinformatic

 A.11 Elaborarea și diseminarea ghidului

12

 R12. Baza de date

RG6.10. Alte rezultate specifice domeniului, pe care universitatea le propune la nivel instituțional

1 bază de date interna cu rezultatele analizelor bioinformatice (fișiere .fasta, .gff, .bed sau alte formate relevante)

A.12 Analiză bioinformatică a rezultatelor

 13

R13. Procese-verbale de consiliere

 RG6.07. Activități/instrumente pentru susținerea cercetării (workshop-uri, programe de cercetare,consultanță)

Minim 4 procese verbale de consiliere în vederea inițierii desfăÇurării proiectelor de cercetare ce includ analiza bacteriofagilor

 A.13 Ședințe de consiliere

 14

 R14. Proiecte selectate

RG6.07. Activități/instrumente pentru susținerea cercetării (workshop-uri, programe de cercetare,consultanță)

Minim 1 proiect selectat în vederea susținerii teoretice (analize bioinformatice) și practice (tehnici de laborator)

 A.13 Ședințe de consiliere

15

R15. Raport tehnico-financiar proiect

RG6.10. Alte rezultate specifice domeniului, pe care universitatea le propune la nivel instituțional

1 raport intermediar tehnic și financiar și 1 raport final de îndeplinire obiective Çi indicatori de rezultat asumați

A.14 Management și implementare L1-L9