Plăci de cultură în hota de biosiguranță, Metagenomic Reference Center

Metagenomic Reference Center (MRC) este primul centru de referință dedicat metagenomicii din România, înființat la Universitatea de Medicină și Farmacie „Victor Babeș” din Timișoara prin proiectul METAGEN (ROHU00049), finanțat prin Programul Interreg VI-A România–Ungaria. MRC folosește secvențierea de nouă generație (Oxford Nanopore) și analiza bioinformatică pentru a identifica agenții patogeni și genele de rezistență la antibiotice din izolate bacteriene, probe biologice și ape uzate de spital.

Activitatea MRC este de cercetare și supraveghere. Datele generate privind speciile bacteriene și genele de rezistență pot sprijini deciziile de sănătate publică și de terapie. Utilizarea în scop diagnostic este un obiectiv de dezvoltare viitoare.

Statut și acte de funcționare

Act

Conținut

H.S. nr. 315/22280/23.09.2025

Înființarea și recunoașterea MRC ca structură independentă în cadrul UMFVBT

H.C.A. nr. 25/27150/28.10.2025 și H.S. nr. 357/27330/29.10.2025

Aprobarea Regulamentului de înființare, organizare și funcționare a MRC (cod UMFVBT-REG/MRC/38/2025) 

Decizia Rectorului nr. 42/30.01.2026

Numirea Comitetului Director al MRC

Autorizația sanitară de funcționare nr. 414/R/04.08.2026

Emisă de Direcția de Sănătate Publică a Județului Timiș pentru obiectivul MRC din Piața Eftimie Murgu nr. 1, Timișoara – document PDF

Autorizația sanitară acoperă următoarele activități (cod CAEN): 8691 – Servicii de diagnostic imagistic și activități ale laboratoarelor medicale; 7210 – Cercetare-dezvoltare în științe naturale și inginerie; 8699 – Alte activități referitoare la sănătatea umană n.c.a.; 7120 – Activități de testări și analize tehnice.

Conducere – Comitetul Director

Funcție

Responsabil

Director MRC

Prof. univ. dr. Iulia Andreea Pînzaru

Compartimentul Metagenomică și Metatranscriptomică (Wet Lab)

Prof. univ. dr. Ioan Ovidiu Sîrbu

Compartimentul Bioinformatică și Analiză de Date (Dry Lab)

Ș.l. dr. Aimee Rodica Chiș

Compartimentul Stocare și Management al Probelor Biologice (Biobanca MRC)

Prof. univ. dr. Cătălin Valer Marian

Compartimentul Inovare, Dezvoltare și Transfer Tehnologic (IDTT)

Prof. univ. dr. Monica Licker

Compartimentul Training și Comunicare

Prof. univ. dr. Florin George Horhat

Echipa de implementare a proiectului METAGEN constituie echipa fondatoare a Metagenomic Reference Center.

Structura funcțională

MRC funcționează la demisolul clădirii din Piața Eftimie Murgu nr. 1, cu un circuit unidirecțional al probelor, separat pe etape de lucru. Conform autorizației sanitare, structura funcțională cuprinde:

  • Camera de primire a probelor biologice – recepție, înregistrare, triaj;
  • Camera de purificare a acizilor nucleici (ADN/ARN) / arie pre-PCR – Wet Lab;
  • Camera PCR – Wet Lab;
  • Camera NGS – secvențiere de nouă generație, Wet Lab;
  • Compartimentul de bacteriofagi – Wet Lab;
  • Camera de coordonare / infrastructura IT – Bioinformatică și Analiză de Date (Dry Lab);
  • spații anexe: hol, vestiar, arhivă, birou, sterilizare, spațiu de depozitare, depozit de materiale și reactivi, grupuri sanitare.
Fluxul de lucru: de la probă la date

Etapa

Ce se întâmplă

1. Primirea probei

Înregistrare, triaj, trasabilitate

2. Purificarea acizilor nucleici

Extracția ADN/ARN din izolate, probe biologice și ape uzate

3. PCR / controlul calității

Amplificare și verificarea calității materialului genetic, în spațiu separat

4. Secvențiere Nanopore

Pregătirea librăriilor și secvențierea (MinION, GridION, PromethION)

5. Analiză bioinformatică

Identificarea speciilor și a genelor de rezistență la antibiotice

6. Biorepository

Păstrarea ADN-ului purificat și a metadatelor pentru cercetări ulterioare

Echipamente

Prin proiect, MRC a fost dotat cu: sisteme de secvențiere Oxford Nanopore (MinION, GridION, PromethION), sistem automat de pipetare (Myra), hote de biosiguranță, centrifuge, pipete, sisteme de refrigerare și congelare pentru aplicații biomedicale, sistem de producere a apei ultrapure și alte sisteme complementare.

De la șantier la laborator

Spațiul MRC a fost renovat integral: instalații refăcute, ziduri decapate până la cărămidă, circuite noi. Lucrările s-au încheiat oficial la 17 decembrie 2025, cu luni înainte de termen. Galeria prezintă aceleași încăperi în momente diferite: situația inițială (martie 2025), renovarea (octombrie 2025), laboratorul funcțional (aprilie 2026) și centrul operațional, autorizat DSP (octombrie 2026).

„Mă pregătisem pentru secvențieri complicate. Nu mă pregătisem să învăț și despre zidărie și tencuieli.” – Prof. univ. dr. Iulia Andreea Pînzaru, Director MR

Holul

Primirea probelor

Camera de purificare a acizilor nucleici

Camera PCR

Camera NGS

Compartimentul de bacteriofagi

Depozitul

Camera de coordonare / infrastructura IT

Din șantier – octombrie 2025

Supravegherea apelor uzate de spital

MRC desfășoară un program prospectiv de supraveghere a apelor uzate. Probele se colectează săptămânal, în fiecare miercuri, de la fiecare spital participant și din alte puncte de interes, pe un ciclu de un an, și se analizează prin secvențiere Nanopore. Colectarea și transportul probelor sunt asigurate de Aquatim S.A., în baza acordului din 14.02.2026. Corelarea semnalelor de rezistență din apele uzate cu izolatele clinice din aceleași spitale oferă o imagine mai completă a circulației genelor de rezistență.

Colaborări

Pe lângă partenerii proiectului METAGEN (Universitatea din Szeged și Asociația OncoHelp) și cele patru spitale clinice din Timișoara, MRC colaborează cu Aquatim S.A. (supravegherea apelor uzate, acord din 14.02.2026) și cu Agenția Națională pentru Sănătate Publică din Republica Moldova (supravegherea rezistenței la antimicrobiene prin secvențiere metagenomică, în abordare One Health, acord din 17.04.2026).

Contact

Metagenomic Reference Center · Universitatea de Medicină și Farmacie „Victor Babeș” din Timișoara · Piața Eftimie Murgu nr. 1, Timișoara · mrc@umft.ro

Metagenomic Reference Center – octombrie 2026