METAGEN reunește trei instituții din România și Ungaria, cu competențe complementare: metagenomică și bioinformatică la Timișoara, monitorizare terapeutică și microbiologie avansată la Szeged, acces la probe clinice de la pacienți oncologici prin Asociația OncoHelp.

Universitatea de Medicină și Farmacie „Victor Babeș” din Timișoara – Partener lider
Coordonează proiectul și răspunde de implementarea lui în fața Autorității de Management. Prin METAGEN, UMFVBT a înființat Metagenomic Reference Center (MRC), unde se fac secvențierea Nanopore și analiza bioinformatică a probelor colectate în România, se păstrează biorepository-ul de probe și se coordonează baza de date a genelor de rezistență.
Manager de proiect: Prof. univ. dr. Iulia Andreea Pînzaru · mrc@umft.ro · www.umft.ro
Universitatea din Szeged (SZTE), Ungaria – Partener 2
Prin proiect sunt modernizate Departamentul de Microbiologie Medicală și Institutul de Medicină de Laborator ale Universității din Szeged, cu secvențiere Nanopore, TapeStation, IR Biotyper, Digital Droplet PCR și LC-MS/MS. Echipa SZTE contribuie cu expertiză în monitorizarea terapeutică a antibioticelor, organizează traininguri pentru specialiștii din România, selectează participanții maghiari la trainingurile de la Timișoara și participă la elaborarea Planului de acțiune AMR România–Ungaria.
Manager de proiect SZTE: Sándor Kitti · Coordonator profesional: Prof. dr. Burián Katalin · www.u-szeged.hu

Asociația OncoHelp, Timișoara – Partener 3
Asigură accesul la o colecție diversă și reprezentativă de probe clinice de la pacienți oncologici, o populație deosebit de vulnerabilă la infecțiile cu germeni multirezistenți, și contribuie la integrarea datelor clinice și la diseminarea rezultatelor.
Manager de proiect OncoHelp: Dr. Valeriu Borugă · www.oncohelp.ro
Probele analizate în METAGEN provin din patru mari spitale clinice din Timișoara, care colaborează cu UMFVBT pe toată durata proiectului, în baza unor acorduri de colaborare:
- Spitalul Clinic Județean de Urgență „Pius Brînzeu” Timișoara
- Spitalul Clinic Municipal de Urgență Timișoara
- Spitalul Clinic de Boli Infecțioase și Pneumoftiziologie „Dr. Victor Babeș” Timișoara
- Spitalul Clinic de Urgență pentru Copii „Louis Țurcanu” Timișoara
Specialiștii acestor spitale și ai Asociației OncoHelp pot participa la activitățile de formare organizate prin METAGEN.
Aquatim S.A. – supravegherea apelor uzate
Prin Acordul de colaborare încheiat la 14 februarie 2026, UMFVBT, prin Metagenomic Reference Center, și Aquatim S.A. colaborează la monitorizarea metagenomică a apelor uzate urbane și spitalicești. Acordul integrează explicit proiectul METAGEN:
- Aquatim identifică și validează punctele de prelevare a apelor uzate aferente celor patru spitale și Asociației OncoHelp, colectează probele și le transportă la MRC;
- MRC procesează probele, extrage ADN-ul, face secvențierea metagenomică shotgun și analiza bioinformatică și interpretează datele în context de sănătate publică și One Health.
Probe de ape uzate de spital, procesate la Metagenomic Reference Center
Corelarea semnalelor de rezistență din apele uzate cu izolatele clinice din aceleași spitale oferă o imagine mai completă a circulației genelor de rezistență. Acordul este încheiat pe o perioadă de 5 ani.
Agenția Națională pentru Sănătate Publică (ANSP), Republica Moldova
Acordul de colaborare din 17 aprilie 2026 prevede participarea MRC la subprogramul „Supravegherea rezistenței la antimicrobiene prin utilizarea tehnologiei de secvențiere metagenomică” din Programul Instituțional 2024–2027 al ANSP, în abordare One Health. Colaborarea cuprinde:
- cercetări comune pe tulpini izolate și pe probe de origine umană, animală și de mediu;
- coordonarea sau co-supervizarea de teze de doctorat și stagii;
- acces reciproc, planificat, la infrastructura de laborator și de analiză a datelor.
